Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3BQ7Z3V4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms