Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SV2AQ7L0J3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms