Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUFY3Q7L099 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUFY3Q7L099 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms