Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HECW1Q76N89 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC33■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HECW1Q76N89 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HECW1Q76N89 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms