Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZD4Q76G19 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms