Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP31Q70CQ4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
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