Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms