Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW63

KDELC1, KDEL motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELC1Q6UW63 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KDELC1Q6UW63 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDELC1Q6UW63 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms