Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC25A47Q6Q0C1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms