Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDF2Q6PJF5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms