Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZCCHC12Q6PEW1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms