Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1Q6P1K2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMF1Q6P1K2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms