Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD54Q6NXT1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms