Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCSD1Q6JBY9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCSD1Q6JBY9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms