Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA2Q69YH5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms