Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATRNL1Q5VV63 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms