Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EFCAB2Q5VUJ9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EFCAB2Q5VUJ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
EFCAB2Q5VUJ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms