Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms