Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF38BQ5VTL8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms