Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms