Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LDLRAD1Q5T700 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LDLRAD1Q5T700 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms