Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms