Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C6orf141Q5SZD1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C6orf141Q5SZD1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms