Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms