Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf116Q5BN46 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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C9orf116Q5BN46 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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