Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms