Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCBP3Q53F19 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCBP3Q53F19 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms