Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms