Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GREB1Q4ZG55 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GREB1Q4ZG55 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms