Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPRNQ4KMQ1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TPRNQ4KMQ1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPRNQ4KMQ1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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