Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms