Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HFEQ30201 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HFEQ30201 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HFEQ30201 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HFEQ30201 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HFEQ30201 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HFEQ30201 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HFEQ30201 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HFEQ30201 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HFEQ30201 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HFEQ30201 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HFEQ30201 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HFEQ30201 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HFEQ30201 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HFEQ30201 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HFEQ30201 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HFEQ30201 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HFEQ30201 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HFEQ30201 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HFEQ30201 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HFEQ30201 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HFEQ30201 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HFEQ30201 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HFEQ30201 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HFEQ30201 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HFEQ30201 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms