Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q1T7F1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q1T7F1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q1T7F1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q1T7F1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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