Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPROQ16827 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms