Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA3Q16787 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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