Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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PDK4Q16654 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PDK4Q16654 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PDK4Q16654 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PDK4Q16654 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PDK4Q16654 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PDK4Q16654 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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