Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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