Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SSX1Q16384 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SSX1Q16384 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SSX1Q16384 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SSX1Q16384 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SSX1Q16384 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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SSX1Q16384 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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SSX1Q16384 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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SSX1Q16384 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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SSX1Q16384 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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SSX1Q16384 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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SSX1Q16384 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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SSX1Q16384 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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