Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA3Q16281 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNGA3Q16281 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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