Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP6AP1Q15904 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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