Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USF2Q15853 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USF2Q15853 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
USF2Q15853 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
USF2Q15853 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
USF2Q15853 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USF2Q15853 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USF2Q15853 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USF2Q15853 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USF2Q15853 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USF2Q15853 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USF2Q15853 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USF2Q15853 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USF2Q15853 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USF2Q15853 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USF2Q15853 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms