Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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