Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRADDQ15628 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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