Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTH1Q15438 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH1Q15438 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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