Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B3Q15393 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
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