Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF4Q15306 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF4Q15306 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms