Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NKX1-1Q15270 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms