Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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