Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PCLAFQ15004 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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