Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GAPVD1Q14C86 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
GAPVD1Q14C86 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GAPVD1Q14C86 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
GAPVD1Q14C86 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
GAPVD1Q14C86 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC35■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
GAPVD1Q14C86 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
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